类器官STR

STR（Short Tandem Repeat）细胞株鉴定是用于验证和识别细胞株的一种常见方法。它通过分析细胞DNA中特定的短串联重复序列来鉴定细胞株的身份。STR广泛存在于人类及哺乳动物的基因组中，具有高度多态性，它们一般由2-6个碱基构成一个核心序列，核心序列串联重复排列，由核心序列重复数目的变化产生长度多态性。其多态性主要源自核心序列重复次数在个体间的差异，因此利用STR可以有效进行细胞鉴定。大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的有效和准确的方法之一，STR基因分型应用于细胞鉴定已被ATCC等机构强烈推荐。美国的ATCC细胞库，德国的DSMZ细胞库以及日本的JCRB细胞库等为STR分型提供了各种细胞株的数据供比对。

细胞STR鉴定即通过STR信息建立细胞系的遗传特性，根据STR分型结果可以对细胞的生长状态（是否存在交叉污染）和细胞的株系进行确认，已被ICLAC、ATCC等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定。细胞系的STR分型被检测出来后，通常需去ATCC或DSMZ数据库进行8个核心STR位点+1个Amelogenin位点的比对，以得到匹配结果与对应匹配百分比，从而推算出样品所属的细胞系或可能交叉污染的细胞系名称。

类器官STR鉴定则相对简单。人类基因组DNA中平均每6～10 kb就有一个STR位点，其多态性成为法医物证检验个人识别和亲子鉴定的丰富来源。将类器官与亲本的STR分型结果进行比对，即可鉴定类器官是否由亲本构建而来。

常见问题：

1、污染问题：细胞株之间的污染可能导致STR分析结果不准确。解决方法包括确保细胞的分离和培养条件严格控制，以防止污染。

2、细胞株不稳定：细胞在培养中可能发生遗传变异，导致STR分析结果与原始细胞株不匹配。为了解决这个问题，应定期重新鉴定细胞株并建立冻存备份。

3、数据解释问题：STR分析产生的数据需要进行解释和比对，可能需要与已知数据库中的STR数据进行比对，以确定细胞株的身份。解释数据时要注意数据处理和分析的标准化，以减少误差。

4、细胞株交叉污染：在实验室中，不小心将不同细胞株的细胞混合在一起可能导致细胞株鉴定错误。为了避免这种问题，需要在操作细胞株时应在管理标准化高的实验室进行检测。